На следующий день после расстрела Царской семьи, в 18 км от города Алапаевска у рудника Нижняя Селимская, большевиками были убиты:
великая княгиня Елизавета Фёдоровна;
великий князь Сергей Михайлович;
князь императорской крови Иоанн Константинович;
князь императорской крови Константин Константинович (младший);
князь императорской крови Игорь Константинович;
князь Владимир Павлович Палей (сын великого князя Павла Александровича от его морганатического брака с Ольгой Пистолькорс);
Фёдор Семёнович (Михайлович) Ремез, управляющий делами великого князя Сергея Михайловича;
сестра Марфо-Мариинской обители Варвара (Яковлева), келейница Елизаветы Фёдоровны.
Великую княгиню Елизавету Федоровну арестовали в 1918 году. В этот день святейший патриарх Тихон посетил Марфо-Мариинскую обитель и отслужил там Божественную Литургию. Почти сразу после его отъезда за настоятельницей приехала машина с комиссаром и латышскими стрелками. В сопровождении сестры Варвары Яковлевой, пожелавшей разделить крест с великой княгиней, матушка Елизавета отправилась в ссылку.
Заключенных Романовых на поезде отвезли на Урал — в городок Алапаевск, где в течение двух месяцев они находились в здании местной Напольной школы на окраине города.
Ночью 18 июля 1918 года узников вывели под конвоем на старый рудник, избили и живыми стали сбрасывать в глубокую шахту. Убийцы даже не взяли с собой оружия, рассчитывая на то, что узники разобьются и переломаются. А когда услышали, что мученики ещё живы, поехали за гранатами и забросали ими шахту… Но ещё несколько дней доносилось оттуда пение церковных молитв и стоны.
Через несколько месяцев в Екатеринбург вошла армия адмирала Колчака, и тела убиенных достали из алапаевской шахты. Как выяснило следствие, некоторые мученики погибли мгновенно, другие медленно умирали от травм и голода. Матушка Елизавета и великий князь Иоанн упали на выступ в стене шахты. Оторвав от своего апостольника часть ткани, Елизавета Федоровна смогла перевязать раны князя. У преподобномученицы Елизаветы, сестры Варвары и у некоторых других мучеников пальцы были сложены для крестного знамения. Тело великой княгини Елизаветы осталось нетленным. После торжественного отпевания гробы почти год стояли в склепе около Троицкого собора.
Через год, во время наступления красных, восемь гробов были переправлены в Читу в сопровождении игумена Серафима (Кузнецова). Из Читы — через Харбин в Пекин, где тела князей и Фёдора Ремеза были преданы земле. Могилы их позже были уничтожены по требованию коммунистов. Тела княгини Елизаветы Федоровны и инокини Варвары были переправлены в Иерусалим и положены в церкви Равноапостольной Марии Магдалины в Гефсимании, как и мечтала Елизавета Федоровна.
Русская Православная Церковь Заграницей канонизировала всех убиенных под Алапаевском (кроме Фёдора Ремеза) в лике мучеников. Русская Православная Церковь причислила к лику святых только двух из них — великую княгиню Елизавету Фёдоровну и инокиню Варвару.